Սիսիան քաղաքի հայտնի ջրային հայելիներից 300 մետր հեռավորության վրա Որոտան գետ լցվող կեղտաջրերը փոխում են ջրի գույնը։ Որոտանը տարիների ընթացքում շարունակում է մնալ Սիսիանի միակ կոյուղատարը։ Երեք տարբեր տեղերից գետ են լցվում քաղաքի կենցաղային և արտադրական կեղտաջրերը։
Սիսիանում մաքուր գետ և շրջակա միջավայր ունենալու հեռանկարը դեռևս 80-ական թվականների վերջերին շատ մոտ էր իրականությանը։ Թվում էր՝ շատ շուտով կեղտաջրերի և գետը աղտոտելու խնդիրը մեկընդմիշտ կլուծվի, սակայն կառուցվող մաքրման կայանը, որի շինարարությունն այդպես էլ մնաց անավարտ, չարդարացրեց սիսիանցիների սպասումները։Հիդրոօդերևութաբանության եւ մոնիթորինգի կենտրոնի տվյալներով՝ 2022-ի թվականինՈրոտան գետի ջուրը Սիսիան քաղաքից 6 կմ ներքև հատվածում եղել է 4 դասի՝ անբավարար։ Սա նշանակում է՝ մակերևութային ջրերի որակի գնահատման 5 դասային սանդղակով այն 2-րդ ամենավատ ցուցանիշն է։ Իսկ այս տարվա առաջին եռամսյակում՝ վատ որակի։ Գետի ջրում հայտնաբերված քիմիական տարրերը զգալիորեն գերազանցել են նորման։ Սովորաբար ջրերի որակը քաղաքային բնակավայրերից հետո շատ ավելի վատն է լինում, քան մինչ այդ, որովհետև առանց մաքրվելու գետ են լցվում քաղաքում եղած կենցաղային և արտադրական կեղտաջրերը։
